Transakční protokol eSSL je hlavním prvkem pro důvěryhodnost digitálních služeb. Systematicky zaznamenává a umožňuje zpětně kontrolovat veškeré operace v systému, včetně změn v dokumentech i jejich metadatech. Slouží také jako nástroj pro dohledání historie činností uživatelů.
Tyto digitální záznamy jsou spolehlivé, pokud jsou pořizovány systematicky a chráněny proti neoprávněným změnám. Proto NSESSS požaduje pravidelné zaznamenávání transakčních protokolů eSSL v podobě určené pro trvalé uložení. Díky tomu je posílena důvěryhodnost eSSL a zajištěna možnost ověřit autenticitu.
Záznamy v eSSL mohou být ovlivněny například kybernetickými útoky, nebo nedokumentovanými zásahy do databáze. Proto je důležité pravidelné vytváření a archivace transakčních protokolů. Pro transakční protokoly platí doporučený skartační režim, který zařizuje, aby se co nejdříve dostal do archivu jako archiválie. Odpovědnost za zařazení do archivu nese původce.
Při výběru archiválií je nutné tento protokol předkládat, nestačí jen dílčí záznamy spojené s jednotlivými dokumenty nebo spisy. Uchovávání je důležité i pro zpětnou kontrolu úřední činnosti.