V české verzi aplikace Adobe Acrobat Reader už je znovu správně používán pojem kvalifikovaný elektronický podpis. Předchozí verze programu pracovaly s nepřesným označením, které neodpovídalo terminologii českých ani evropských pravidel pro služby vytvářející důvěru. Tím však potíže neskončily. Stále přetrvává problém při validaci některých kvalifikovaných a uznávaných elektronických podpisů založených na certifikátech poskytovatele I.CA.
Při kontrole elektronického podpisu aplikace ověřuje řetězec certifikátů až k tzv. kotvě důvěry. V prostředí EU vychází zejména z evropských a národních důvěryhodných seznamů, které obsahují kvalifikované poskytovatele a jejich služby. Některé certifikáty I.CA program vyhodnotí jako důvěryhodné, ale ne kvalifikované. Uživatelé proto musí používat aktuální verzi a nespoléhat pouze na grafické hlášení aplikace. U některých případů bude potřeba provést kontrolu také jiným validátorem.
Chybné nebo neúplné zobrazení v konkrétní aplikaci nemusí samo o sobě prokazovat neplatnost dokumentu. Pozornost je třeba věnovat také elektronickým časovým razítkům. Některé běžně používané nástroje přestanou po skončení platnosti certifikátu časového razítka vyhodnocovat podpis jako ověřený. Technické standardy však za určitých podmínek připouštějí důvěru i v razítko založené na expirovaném certifikátu.