Komponenty dokumentů v digitální podobě, které jsou zašifrovány, je možné při podání považovat za vadné. Stává se to v případě, že původce nemá dešifrovací klíč. Veřejnoprávní původci by měli postupovat stejně jako u ostatních vad, které činí dokumenty nečitelné.
Pokud má původce k dispozici dešifrovací klíč, zpracování těchto šifrovaných komponent je stále obtížné. Klíč navíc nemusí být k dispozici po uplynutí skartační lhůty – pak by takový dokument musel být považovaný za zničený a už ho nelze navrhnout pro výběr archiválií do skartačního řízení.
Národní archiv v takovém případě doporučuje, aby původci nepřijímali dokumenty s takovou ochranou
a uvedly to také mezi zveřejněnými informacemi. Podle stejného pravidla by takové dokumenty neměli ani odesílat.
Pokud přesto z nějakého důvodu chcete nebo musíte přijímat dokumenty s šifrovanými komponentami, je nutné uchovat dešifrovací klíč v metadatech dokumentu v eSSL.